مجتبی خامنهای در واکنش به تفاهمنامه با آمریکا گفت که نظر دیگری داشته، اما به دلیل تعهدی که مسعود پزشکیان به او داده، با امضای آن موافقت کرده است.
چهرههای اصولگرا و برخی نمایندگان مجلس از پیام منسوب به مجتبی خامنهای دربارهٔ تفاهمنامه با آمریکا انتقاد کردند و خواستار پاسخگویی حامیان این روند شدند. محمدمنان رییسی و محسن مقصودی از این گروه بودند و از عدم توجه به دیدگاه رهبر جمهوری اسلامی در مذاکرات انتقاد کردند.
مجتبی خامnehای، پسر ابراهیم خامnehای، در پیامی زیرنویس صدا و سیما مخالفت خود با تفاهمنامه اعلام کرد و اشاره کرد که با توجه به تعهدات رئیسجمهور، این موضوع را مجاز دانسته است. او همچنین ابراز داشت که هرگونه مذاکرهای در آینده نباید به منزله پذیرش دیدگاه دشمن تلقی شود.
